Depósito de tejidos humanos y análisis de tejidos

El Repositorio de Tejidos Humanos y el Recurso Compartido de Análisis de Tejidos (HTR-TASR) son financiados conjuntamente por el Centro de Cáncer y el Departamento de Patología. Se han creado para facilitar la investigación traslacional de la facultad en el Centro de Cáncer, el Departamento de Patología, la Facultad de Medicina y en todos los Institutos. Este sitio web describe los servicios ofrecidos y los datos de contacto de los miembros del personal de HTR-TASR que pueden asesorar sobre la disponibilidad de muestras y todos los aspectos de histología y patología molecular.

Propósito

Facilitar la adquisición, el almacenamiento y la distribución de muestras de tejido humano de alta calidad a los investigadores de la UNM para su uso en investigaciones científicas, al tiempo que se observan los principios y reglamentos éticos, científicos y legislativos apropiados.

Usamos la Prácticas recomendadas del NCI para los recursos de muestras biológicas como nuestra guía.

Acerca de HTR-Tissue

El recurso compartido HTR-Tissue:

  • Beneficia a los futuros pacientes al permitir que los investigadores accedan a tejidos bien conservados y mantenidos que de otro modo no estarían disponibles.
  • Beneficia a UNM HSC al fortalecer la misión de brindar atención al paciente de calidad mediante el fomento de la investigación innovadora y clínicamente valiosa
  • La función de intermediario honesto del HTR en la dispensación de muestras anónimas sin los 18 identificadores personales de la HIPAA protege a los investigadores de posibles complicaciones / violaciones de la HIPAA

El TASR proporciona una variedad de servicios de histologia, incluidos varios tipos de tinción inmunohistoquímica e inmunofluorescencia, así como varios técnicas de patología molecular tales como PCR, PCR en tiempo real, extracción de ADN y ARN de tejidos y fluidos e inmunofluorescencia.

Resumen de los servicios HTR-TASR para solicitudes de subvenciones

El Repositorio de Tejidos Humanos y el Recurso Compartido de Análisis de Tejidos (HTR-TASR) tiene la capacidad de realizar una serie de técnicas y ofrece una variedad de servicios con una tarifa por servicio.

El HTR-TASR recolecta tejido normal y tumoral emparejado principalmente de las muestras quirúrgicas desechadas sobrantes y las almacena congeladas o como bloques incluidos en parafina fijados con formalina (FFPE). Los investigadores pueden solicitar los tejidos, con las aprobaciones requeridas de la IRB (Oficina de Protección de la Investigación Humana) y el Comité de Supervisión de la Investigación de Tejidos (TROC, anteriormente SRC).

El HTR-TASR también puede proporcionar una serie de diferentes servicios histológicos y moleculares, como corte y tinción H&E, inmunohistoquímica e inmunofluorescencia utilizando Ventana Discovery Ultra Platform, creación de microarrays de tejidos (TMA) personalizados, digitalización de portaobjetos (campo claro y fluorescente) a través de el Aperio Versa 200, y análisis de imágenes usando la plataforma HALO ™ (de Indica Labs, sede en Albuquerque, NM).

Se encuentran disponibles varios tipos de procesamiento de sangre, incluido el rendimiento del recuento celular y la viabilidad a través del Nexelom Cellometer 1000.

Algunos investigadores requieren muestras especialmente preparadas o tienen requisitos específicos para las muestras. Para estos estudios aprobados, el personal de HTR recolectará prospectivamente las muestras y el proceso adaptado a las necesidades de los investigadores. Además, se encuentran disponibles algunos servicios moleculares, como extracción de ADN y ARN, PCR y PCR en tiempo real. Se debe programar una reunión de viabilidad con el Gerente Técnico y el Gerente de Operaciones para discutir los servicios deseados.

Para reconocer el uso de este recurso compartido, incluya lo siguiente en sus publicaciones:

Esta investigación fue apoyada parcialmente por la Beca de Apoyo al Centro Integral del Cáncer de la UNM NCI P30CA118100 y utilizó el Recurso Compartido del Repositorio de Tejidos Humanos y Análisis de Tejidos, que recibe apoyo adicional del Departamento de Patología de la Facultad de Medicina de la Universidad de Nuevo México.

Póngase en contacto con HTR-Tissue

Teléfono: (505) 272-1127
Correo electrónico: tissuebank@salud.unm.edu
Salas Fitz Hall 306B y 306C
Escuela de Medicina UNM HSC
Departamento de patología
MSC 08-4640
915 Camino de Salud, NE
Albuquerque, NM 87131

Personal de HTR-TA

Dennis McCance, doctoradoDr. Dennis J. McCance

Profesor de investigación, Patología

Director Científico

Supervisa todos los aspectos del recurso.

Dr. Edgar FischerDr. Edgar Fischer

Profesor, Patología

Directora Médica

Supervisa los aspectos de control de calidad del recurso.

Cathleen Martínez, PDCathleen Martínez PA

Gerente Técnico

Supervisa los aspectos técnicos del recurso.

Sadie La Bauve, Doctora en FilosofíaDoctora Sadie La Bauve

Especialista operacional

Maneja las responsabilidades del día a día

Fred Schultz, MAFred Schultz, MA

Gestión informática

Servicios de Histología y Patología Molecular

Procesamiento de tejidos e inclusión en parafina o congelación rápida de tejidos. El tejido puede teñirse con tinción H&E o permanecer sin teñir.

El laboratorio puede teñir secciones de tejido con anticuerpos estándar utilizando protocolos ya establecidos. Alternativamente, el laboratorio puede trabajar con anticuerpos utilizando la plataforma VENTANA DISCOVERY que permite múltiples combinaciones de tinción para optimizar los resultados de la tinción.

Imagen de HER-2 y ER
Tinción doble para HER-2 y ER

Los anticuerpos marcados con fluorescencia también se pueden usar para detectar su proteína de interés.

Microarrays de tejido HTR - e-cadherin

Diseño y construcción de micromatrices de tejidos: esto implica recolectar bloques de parafina de los donantes, seleccionar las áreas de interés para extraer el núcleo y colocar los núcleos en un bloque de parafina del receptor en blanco. Las ventajas están en la velocidad y el costo, ya que se pueden evaluar varias muestras en un portaobjetos. El TMA típico contiene aproximadamente de 50 a 200 núcleos de 0.6 mm a 2.0 mm de diámetro. Se pueden obtener aproximadamente 50 secciones de un bloque TMA.

 

(A la derecha: E-cadherin)

El personal de HTR-TASR puede recuperar bloques de tejido de archivo del Hospital UNM.

Esto generalmente comprende la recolección de tejido sobrante o remanente en el momento de la resección quirúrgica después de que se hayan tomado muestras de diagnóstico para la revisión microscópica del patólogo quirúrgico y se haya retenido suficiente muestra en parafina para posibles pruebas futuras para el cuidado del paciente. El personal de HTR-TASR recogerá los tejidos en la sala de disección macroscópica de patología quirúrgica UNM HSC. Actualmente, el HTR no realiza punciones venosas, pero almacenará las muestras según lo soliciten los investigadores.

Los consultores del proyecto HTR-TASR pueden recopilar datos clínicos y patológicos a los que se les quitan los identificadores de HIPAA mientras se codifican en muestras coincidentes.

  1. Aislamientos de ADN y ARN de múltiples tipos de muestras (por ejemplo, sangre fresca / congelada, células transformadas, tejido congelado, tejido incluido en parafina); incluida la cuantificación y evaluación de la calidad del ARN.
  2. Amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) a partir de objetivos de ADN o ARN, incluido el diseño de cebadores, la optimización de la PCR, la configuración de la PCR y la RT-PCR y la electroforesis en gel para garantizar la calidad.
  3. Cuantificación de la expresión génica (PCR en tiempo real): incluido el diseño de cebadores.

Análisis de imagen

Las imágenes de H&E o secciones de tejido teñidas inmunohistoquímicamente o secciones de inmunofluorescencia se capturan en el escáner digital Leica Versa 200 y se cargan en el software de anotación e imágenes HALO.

El software HALO le permite anotar el tejido (tumor, estroma, músculo, grasa, etc.) y luego contar las células que son positivas para la proteína de su elección (Figura, derecha) dentro de cada una de estas regiones anotadas. También le permitirá analizar y cuantificar las interacciones de los vecinos más cercanos.

El software incluye una herramienta de creación de figuras que puede crear fotografías de imágenes de varios paneles en formatos publicables, incluidos marcos de referencia y barra de escala

Imagen de resultados cuantitativos

Esta figura muestra la cuantificación de la tinción para Ki67 en cáncer de mama. El panel superior izquierdo muestra la muestra de microarrays de tejido, el panel central muestra tinción Ki67 (marrón) sin el marcado HALO y el panel derecho muestra la misma imagen con el marcado HALO.

El marcado muestra tinción de bajo nivel (amarillo), tinción moderada (marrón) y niveles altos (rojo) de Ki67 en el núcleo de las células tumorales. La tinción azul son células que son negativas para Ki67. El software puede contar de forma independiente la tinción Ki67 en el estoma del tumor.

La tabla muestra una lectura del número y el porcentaje de células en cada categoría de tinción y el histograma muestra la distribución de la tinción.

Cómo solicitar muestras

Contacto cathy martinez or Sadie LaBauve para programar.

Abra su cuenta en iLab:

  1. Navegue hasta la Página de inicio de sesión de iLabs.
  2. En la esquina superior derecha de la pantalla, seleccione Regístrate
  3. Complete el formulario de registro en la página de registro.
  4. Reciba un correo electrónico de bienvenida de iLab con credenciales de inicio de sesión e instrucciones

Solicitud de servicios en iLab:

  1. Establezca una Solicitud de Compra (PR) a través de su departamento. Envíe un correo electrónico al RP a Sabrina Samudio-RuizAbel Tarango-Prieto solicitando que se agregue en su laboratorio en el sistema iLab.
  2. Visite la Inicio de sesión de iLabs .
  3. En la esquina superior derecha de esta página, ingrese su nombre de usuario y contraseña.
  4. En la pestaña "Solicitar servicios", haga clic en "Iniciar solicitud" junto al servicio de interés (Repositorio de tejidos humanos frente a Servicios de patología molecular).
  5. Complete el formulario y proporcione la información de pago de su solicitud antes de enviar la solicitud al HTR.
    1. Asegúrese de que el título del proyecto y los números de TROC / HRRC / IACUC coincidan con los de sus cartas de aprobación.
    2. Debajo de cada categoría de servicios, ingrese el número deseado y haga clic en la pestaña "Agregar servicios seleccionados". Los servicios se agregarán al final del formulario.
    3. Utilice el cuadro "Información adicional" para agregar cualquier detalle importante y adjunte / cargue cualquier documento relevante, como una lista de muestras o una descripción de orientación.
  6. Las solicitudes estarán pendientes de revisión por parte del HTR, que realizará los cambios necesarios y las enviará para su aprobación. Recibirá un correo electrónico de iLab con respecto a su solicitud de proyecto actualizada.
  1. Envíe su propuesta al Comité de Supervisión de la Investigación de Tejidos (TROC). Póngase en contacto con Karen Capobianco para obtener orientación en este proceso.
  2. Una vez que la TROC apruebe su propuesta, envíe la carta de aprobación con su solicitud a la UNM Comité de Revisión de Investigaciones Humanas (HRRC) Junta de Revisión Institucional (IRB).

Para navegar por el proceso de solicitud del IRB:

  1. En el enlace de arriba, haga clic en el botón "Haga clic en IRB" a la izquierda
  2. Haga clic en la pestaña IRB en la parte superior de la pantalla
  3. Haga clic en el botón "Crear nuevo estudio" a la izquierda.
  4. Rellenar el formulario
  5. En la pregunta # 7, haga clic en el enlace para ir a la biblioteca y seleccione el protocolo apropiado para su estudio.
    1. Si su estudio requiere solo materiales anónimos, seleccione el Protocolo de categoría 4 exento (HRP-582). * Nota: Es posible que los tejidos desechados no identificados no requieran consentimiento
    2. Si su estudio no requiere obtener información sobre individuos vivos, seleccione Investigación con sujetos no humanos (HRP-585)
    3. Puede enviar una presentación acelerada si su estudio incluye solo muestras que se han recolectado únicamente con fines que no son de investigación (como tratamiento médico y diagnóstico).
  6. Después de la aprobación del HRRC, envíe una solicitud de tejido al HTR a través de iLab. Cargará sus cartas de aprobación de SRC e IRB y tendrá un RP activo en el sistema.
  1. Póngase en contacto con el HTR-TASR para una sesión de planificación / viabilidad.
  2. Envíe su propuesta al Comité de Supervisión de la Investigación de Tejidos (TROC). Póngase en contacto con Karen Capobianco para obtener orientación sobre este proceso.
  3. Una vez que la TROC haya aprobado su propuesta, envíe la carta de aprobación con su solicitud a la Junta de Revisión Institucional (IRB) del Comité de Revisión de Investigaciones Humanas (HRRC) de la UNM (consulte las instrucciones anteriores).
  4. Comuníquese con el HTR-TASR para una sesión de planificación adicional (generalmente necesaria para aclarar los detalles del proceso. Esta reunión incluye la obtención de la aprobación del Jefe de División de Patología Quirúrgica para garantizar la disponibilidad de las muestras mientras se mantiene el cumplimiento de las regulaciones nacionales de laboratorio y la mejor atención al paciente.
  5. Si le queda tejido después del cierre de su investigación, debe devolverlo al HTR
  1. Debe obtener la aprobación del Comité de Revisión de Investigaciones en Humanos local si alguna parte del tejido recolectado puede potencialmente usarse para investigación.
  2. El Jefe de División de Patología Quirúrgica o su designado debe aprobar el método de recolección de muestras para garantizar que se retiene suficiente tejido representativo para la atención clínica.

Inventario

Sitio de los tejidos recolectados

(Incluye tejido de archivo de UNM y colección prospectiva para investigadores para estudios específicos).

  • Vejiga, Sangre, Hueso, Médula Ósea, Cerebro, Mama
  • Pared torácica, colorrectal
  • Diafragma
  • Vesícula biliar
  • Cabeza y Cuello
  • Riñón
  • Hígado, pulmón, ganglio linfático
  • Mediastino
  • Epiplón, ovario
  • Páncreas, pene, peritoneo, próstata
  • Saliva, Glándula salival, Piel, Intestino delgado, Tejido blando, Bazo, Estómago
  • Testículo, timo, tiroides
  • Útero y cuello uterino
  • Vagina / Vulva

Registro ampliado de cáncer de mama (EBCR)

Se trata de una colección de tejido complicada que consta de más de 400 pacientes con consentimiento con múltiples puntos de tiempo y tipos de tejido recogidos. Se recogió lo siguiente de cada paciente:

  • 5 alícuotas de suero máximo / participante / colección (como tiempo de referencia o FUP)
  • 10 alícuotas de plasma máximo / participante / colección
  • 10 alícuotas de ADN de sangre total / participante / colección
  • 2 alícuotas de ADN como máximo de enjuague bucal o hisopo / participante / colección
  • tejido mamario (aspirados con aguja fina, viales y moldes OCT): todos los casos son diferentes.

Comuníquese con el HTR-TASR para obtener una consulta más detallada de este conjunto de datos.