Depósito de tejidos humanos y análisis de tejidos

El Repositorio de Tejidos Humanos y Análisis de Tejidos (HTR-TA) es un recurso compartido financiado conjuntamente por el Centro Oncológico Integral de la UNM y el Departamento de Patología. El recurso compartido HTR-TA es... certificado por el Colegio de Patólogos Americanos (CAP).

El recurso compartido HTR-TA se ha creado para facilitar la investigación traslacional del profesorado del Centro Oncológico de la UNM, el Departamento de Patología, la Facultad de Medicina y otros institutos. Este sitio web describe los servicios ofrecidos y la información de contacto del personal del recurso compartido HTR-TA, que puede asesorar sobre la disponibilidad de muestras y todos los aspectos de la histología y la patología molecular.

Propósito

Facilitar la adquisición, el almacenamiento y la distribución de muestras de tejido humano de alta calidad a los investigadores de la UNM para su uso en investigaciones científicas, al tiempo que se observan los principios y reglamentos éticos, científicos y legislativos apropiados.

Acerca del recurso compartido HTR-TA

El recurso compartido HTR-TA:

  • Beneficia a los futuros pacientes al permitir que los investigadores accedan a tejidos bien conservados y mantenidos que de otro modo no estarían disponibles.
  • Beneficia a UNM HSC al fortalecer la misión de brindar atención al paciente de calidad mediante el fomento de la investigación innovadora y clínicamente valiosa
  • La función de intermediario honesto del recurso compartido HTR-TA al dispensar especímenes desidentificados que carecen de los 18 identificadores personales de HIPAA protege a los investigadores de posibles complicaciones o violaciones de HIPAA.

El recurso compartido HTR-TA proporciona una variedad de servicios de histologia, incluido el procesamiento y la inclusión en parafina, el corte en parafina y congelado, la tinción H&E, la tinción IHC, la construcción TMA, la digitalización de portaobjetos y el análisis de imágenes.

Resumen de los servicios HTR-TASR para solicitudes de subvenciones

El recurso compartido de depósito de tejidos humanos y análisis de tejidos (HTR-TA) tiene la capacidad de realizar una serie de técnicas y ofrece una variedad de servicios a cambio de una tarifa por servicio.

El recurso compartido HTR-TA recopila tejido normal y tumoral compatible, principalmente de muestras quirúrgicas descartadas, y lo almacena congelado o en bloques fijados con formalina e incluidos en parafina (FFPE). Los investigadores pueden solicitar los tejidos, previa aprobación de la Junta de Revisión Institucional (JRI) y del Comité de Revisión Científica (CRE).

El recurso compartido HTR-TA también puede proporcionar una variedad de servicios histológicos y moleculares diferentes, como corte y tinción H&E, inmunohistoquímica e inmunofluorescencia mediante la plataforma Ventana Discovery Ultra, creación de microarreglos de tejidos (TMA) personalizados, digitalización de portaobjetos (campo claro) mediante Aperio AT2 y análisis de imágenes mediante la plataforma HALO™ (de Indica Labs, sede en Albuquerque, NM).

Se encuentran disponibles varios tipos de procesamiento de sangre, incluido el rendimiento del recuento celular y la viabilidad a través del Nexelom Cellometer 1000.

Algunos investigadores requieren muestras especialmente preparadas o tienen requisitos específicos. Para estos estudios aprobados, el personal de recursos compartidos de HTR-TA recolectará prospectivamente las muestras y las procesará según las necesidades de los investigadores. Se debe programar una reunión de viabilidad con el Gerente Técnico para analizar los servicios deseados.

Para reconocer el uso de este recurso compartido, incluya lo siguiente en sus publicaciones:

Esta investigación fue financiada parcialmente por la subvención de apoyo del Centro Integral del Cáncer de la UNM NCI P30CA118100 y utilizó el Repositorio de tejidos humanos y recurso compartido de análisis de tejidos, que recibe apoyo adicional del Departamento de Patología de la Facultad de Medicina de la Universidad de Nuevo México.

Contacte con el recurso compartido HTR-TA

Teléfono: (505) 272-1127
Correo electrónico: tissuebank@salud.unm.edu
Salas Fitz Hall 306B y 306C
Escuela de Medicina UNM HSC
Departamento de patología
MSC 08-4640
915 Camino de Salud, NE
Albuquerque, NM 87131

Estándares y acreditación de repositorios

En el recurso compartido HTR-TA de la UNM, nos comprometemos a mantener los más altos estándares en la gestión de bioespecímenes, el control de calidad y la supervisión ética. Nuestras operaciones siguen rigurosas directrices y las mejores prácticas establecidas por importantes organizaciones nacionales e internacionales:

  • Instituto Nacional del Cáncer (NCI) – Rama de Investigación de Biorrepositorios y Bioespecímenes (BBRB)
    Nos adherimos a los principios de BBRB Mejores prácticas para los recursos de bioespecímenes, que brindan orientación integral sobre la recolección, procesamiento, almacenamiento y distribución de bioespecímenes para garantizar la consistencia y la integridad científica.
    https://biospecimens.cancer.gov/default.asp
  • Sociedad Internacional de Repositorios Biológicos y Ambientales (ISBER)
    HTR se alinea con el ISBER Mejores prácticas para repositorios, un marco reconocido internacionalmente para la gestión y gobernanza de biorrepositorios que apoyan la investigación en las ciencias biológicas y ambientales.
    https://www.isber.org/page/BPR
  • Colegio Americano de Patólogos (CAP) – Programa de Acreditación de Biorrepositorios
    HTR se enorgullece de estar acreditado por CAP a través de su Programa de Acreditación de Biorepositorios, que valida nuestro cumplimiento con los estándares líderes de la industria en calidad de bioespecímenes, trazabilidad y excelencia operativa.
    https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation/biorepository-accreditation-program

Estos estándares garantizan que nuestros bioespecímenes y servicios respalden una investigación reproducible y de alta calidad y contribuyan significativamente a los avances en la ciencia del cáncer y la atención al paciente.

Personal de recursos compartidos HTR-TA

joste-nancy-cc.jpgDra. Nancy Joste

Profesor y director del Departamento de Patología

Director Médico

Supervisa los aspectos de control de calidad del recurso.

Cathleen Martínez, PDCathleen Martínez PA

Gerente Técnico

Supervisa los aspectos técnicos del recurso.

Fred Schultz, MAFred Schultz, MA

Gestión informática

Servicios de Histología y Patología Molecular

Procesamiento de tejidos e inclusión en parafina y corte en parafina, así como congelación instantánea de tejido y corte por congelación. Tinción H&E en parafina y secciones congeladas.

El laboratorio puede teñir secciones de tejido con anticuerpos estándar utilizando protocolos ya establecidos. Alternativamente, el laboratorio puede trabajar con anticuerpos utilizando la plataforma VENTANA DISCOVERY que permite múltiples combinaciones de tinción para optimizar los resultados de la tinción.

Imagen de HER-2 y ER
Tinción doble para HER-2 y ER
Microarrays de tejido HTR - e-cadherin

Diseño y construcción de micromatrices de tejidos: esto implica recolectar bloques de parafina de los donantes, seleccionar las áreas de interés para extraer el núcleo y colocar los núcleos en un bloque de parafina del receptor en blanco. Las ventajas están en la velocidad y el costo, ya que se pueden evaluar varias muestras en un portaobjetos. El TMA típico contiene aproximadamente de 50 a 200 núcleos de 0.6 mm a 2.0 mm de diámetro. Se pueden obtener aproximadamente 50 secciones de un bloque TMA.

 

(A la derecha: E-cadherin)

El personal de recursos compartidos HTR-TA puede recuperar bloques de tejido de archivo del Hospital UNM.

Esto generalmente consiste en la recolección de tejido sobrante o remanente tras la resección quirúrgica, tras la toma de muestras diagnósticas para su análisis microscópico por parte del patólogo quirúrgico, y la conservación de suficiente muestra en parafina para posibles análisis futuros para la atención del paciente. El personal del recurso compartido HTR-TA recolectará los tejidos en la Sala de Disección Macroscópica del Departamento de Patología Quirúrgica del HSC de la UNM. Actualmente, el recurso compartido HTR-TA no realiza venopunciones, pero almacenará dichas muestras según lo soliciten los investigadores.

 Los consultores del proyecto de recursos compartidos HTR-TA pueden recopilar datos patológicos y clínicos desprovistos de identificadores HIPAA y codificados en muestras coincidentes.

Análisis de imagen

Las imágenes de H&E o secciones de tejido teñidas inmunohistoquímicamente se capturan en el escáner digital Leica AT2 y se cargan en el software de anotación e imágenes HALO.

El software HALO le permite anotar el tejido (tumor, estroma, músculo, grasa, etc.) y luego contar las células que son positivas para la proteína de su elección (Figura, derecha) dentro de cada una de estas regiones anotadas. También le permitirá analizar y cuantificar las interacciones de los vecinos más cercanos.

El software incluye una herramienta de creación de figuras que puede crear fotografías de imágenes de varios paneles en formatos publicables, incluidos marcos de referencia y barra de escala

Imagen de resultados cuantitativos

Esta figura muestra la cuantificación de la tinción para Ki67 en cáncer de mama. El panel superior izquierdo muestra la muestra de microarrays de tejido, el panel central muestra tinción Ki67 (marrón) sin el marcado HALO y el panel derecho muestra la misma imagen con el marcado HALO.

El marcado muestra tinción de bajo nivel (amarillo), tinción moderada (marrón) y niveles altos (rojo) de Ki67 en el núcleo de las células tumorales. La tinción azul son células que son negativas para Ki67. El software puede contar de forma independiente la tinción Ki67 en el estoma del tumor.

La tabla muestra una lectura del número y el porcentaje de células en cada categoría de tinción y el histograma muestra la distribución de la tinción.

Cómo solicitar muestras

Contacto cathy martinez para programar.

Abra su cuenta en iLab:

  1. Navegue hasta la Página de inicio de sesión de iLabs.
  2. En la esquina superior derecha de la pantalla, seleccione regístrate
  3. Complete el formulario de registro en la página de registro.
  4. Reciba un correo electrónico de bienvenida de iLab con credenciales de inicio de sesión e instrucciones

Solicitud de servicios en iLab:

  1. Establezca una Solicitud de Compra (PR) a través de su departamento. Envíe un correo electrónico al RP a Bandapalli de Palakshi Reddy solicitando que se agregue en su laboratorio en el sistema iLab.
  2. Vaya la Inicio de sesión de iLabs .
  3. En la esquina superior derecha de esta página, ingrese su nombre de usuario y contraseña.
  4. En la pestaña “Solicitar servicios”, haga clic en “Iniciar solicitud”.
  5. Complete el formulario y proporcione la información de pago para su solicitud antes de enviarla al recurso compartido HTR-TA.
    1. Asegúrese de que el título del proyecto y los números SRC/HRRC/IACUC coincidan con los de sus cartas de aprobación.
    2. Debajo de cada categoría de servicios, ingrese el número deseado y haga clic en la pestaña "Agregar servicios seleccionados". Los servicios se agregarán al final del formulario.
    3. Utilice el cuadro "Información adicional" para agregar cualquier detalle importante y adjunte / cargue cualquier documento relevante, como una lista de muestras o una descripción de orientación.
  6. Las solicitudes estarán pendientes de revisión por parte del recurso compartido HTR-TA, que realizará los cambios necesarios y las enviará de vuelta para su aprobación. Recibirá un correo electrónico de iLab con la actualización de su solicitud de proyecto.
  1. Envíe su propuesta al Comité de Revisión Científica (SRC). Contacta con Ernestine Armijo para obtener orientación en este proceso.
  2. Una vez que el SRC apruebe su propuesta, envíe la carta de aprobación con su solicitud a la UNM Comité de Revisión de Investigaciones Humanas (HRRC) Junta de Revisión Institucional (IRB).

Para navegar por el proceso de solicitud del IRB:

  1. En el enlace de arriba, haga clic en el botón "Haga clic en IRB" a la izquierda
  2. Haga clic en la pestaña IRB en la parte superior de la pantalla
  3. Haga clic en el botón "Crear nuevo estudio" a la izquierda.
  4. Rellenar el formulario
  5. En la pregunta # 7, haga clic en el enlace para ir a la biblioteca y seleccione el protocolo apropiado para su estudio.
    1. Si su estudio requiere solo materiales anónimos, seleccione el Protocolo de categoría 4 exento (HRP-582). * Nota: Es posible que los tejidos desechados no identificados no requieran consentimiento
    2. Si su estudio no requiere obtener información sobre individuos vivos, seleccione Investigación con sujetos no humanos (HRP-585)
    3. Puede enviar una presentación acelerada si su estudio incluye solo muestras que se han recolectado únicamente con fines que no son de investigación (como tratamiento médico y diagnóstico).
  6. Tras la aprobación del HRRC, envíe una solicitud de tejido al recurso compartido HTR-TA a través de iLab. Cargará sus cartas de aprobación del SRC y del IRB, y tendrá una solicitud de registro activa en el sistema.
  1. Comuníquese con el recurso compartido HTR-TA para una sesión de planificación/viabilidad.
  2. Envíe su propuesta al Comité de Revisión Científica (SRC). Contacta con Ernestine Armijo para obtener orientación sobre este proceso.
  3. Una vez que el SRC haya aprobado su propuesta, envíe la carta de aprobación con su solicitud a la Junta de Revisión Institucional (IRB) del Comité de Revisión de Investigaciones Humanas (HRRC) de la UNM (consulte las instrucciones anteriores).
  4. Comuníquese con el recurso compartido HTR-TA para una sesión de planificación adicional (generalmente necesaria para aclarar los detalles del proceso). Esta reunión incluye obtener la aprobación del Jefe de División de Patología Quirúrgica para garantizar la disponibilidad de las muestras mientras se mantiene el cumplimiento de las regulaciones nacionales de laboratorio y la mejor atención al paciente.
  5. Si le queda tejido después del cierre de su investigación, debe devolverlo al recurso compartido HTR-TA.
  1. Debe obtener la aprobación del Comité de Revisión de Investigaciones en Humanos local si alguna parte del tejido recolectado puede potencialmente usarse para investigación.
  2. El Jefe de División de Patología Quirúrgica o su designado debe aprobar el método de recolección de muestras para garantizar que se retiene suficiente tejido representativo para la atención clínica.

Inventario

Sitio de los tejidos recolectados

(Incluye tejido de archivo de UNM y colección prospectiva para investigadores para estudios específicos).

  • Vejiga, Sangre, Hueso, Médula Ósea, Cerebro, Mama
  • Pared torácica, colorrectal
  • Diafragma
  • Vesícula biliar
  • Cabeza y Cuello
  • Riñón
  • Hígado, pulmón, ganglio linfático
  • Mediastino
  • Epiplón, ovario
  • Páncreas, pene, peritoneo, próstata
  • Saliva, Glándula salival, Piel, Intestino delgado, Tejido blando, Bazo, Estómago
  • Testículo, timo, tiroides
  • Útero y cuello uterino
  • Vagina / Vulva

Registro ampliado de cáncer de mama (EBCR)

Se trata de una colección de tejido complicada que consta de más de 400 pacientes con consentimiento con múltiples puntos de tiempo y tipos de tejido recogidos. Se recogió lo siguiente de cada paciente:

  • 5 alícuotas de suero máximo / participante / colección (como tiempo de referencia o FUP)
  • 10 alícuotas de plasma máximo / participante / colección
  • 10 alícuotas de ADN de sangre total / participante / colección
  • 2 alícuotas de ADN como máximo de enjuague bucal o hisopo / participante / colección
  • tejido mamario (aspirados con aguja fina, viales y moldes OCT): todos los casos son diferentes.

Comuníquese con el recurso compartido HTR-TA para obtener una consulta más detallada de este conjunto de datos.