El laboratorio de Mao

Peng Mao, doctorado

Profesor
Departamento de Medicina Interna, División de Medicina Molecular
La universidad de nuevo mexico
915 Camino de Salud NE
Albuquerque, NM 87131

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Oficina: (505) 272, 7824

Peng Mao, doctorado
Peng Mao, doctorado, investigador principal

Daño al ADN, reparación del ADN y mutaciones cancerosas

La inestabilidad del genoma es una característica destacada del cáncer. Una fuente importante que aumenta la inestabilidad del genoma es el daño del ADN. El ADN de todas las células vivas es atacado constantemente por agentes que dañan el ADN. El daño resultante en el ADN, si no se repara, interfiere con la replicación del ADN y aumenta significativamente las mutaciones. Investigar cómo surge el daño en el ADN y cómo se repara en la célula es importante para comprender los mecanismos de mutación del cáncer. El Dr. Peng Mao utiliza secuenciación de última generación (NGS) y métodos bioinformáticos para estudiar dónde se forma el daño en el ADN en el genoma y cómo funcionan las proteínas de reparación del ADN en el contexto de la cromatina. Ha desarrollado dos métodos de vanguardia, a saber, CPD-seq y NMP-seq, para el mapeo de todo el genoma de fotolesiones inducidas por UV y pequeñas modificaciones de base inducidas por agentes alquilantes.

CPD-seq (Mao et al., PNAS, 2016; Mao et al., Nature Communications, 2018)

CPD-seq (Mao et al., PNAS, 2016; Mao et al., Nature Communications, 2018)

Con estos métodos de mapeo de alto rendimiento, quiere abordar tres preguntas importantes para el mecanismo de mutagénesis en las células cancerosas: (1) ¿Cómo funcionan las proteínas de reparación del ADN en la cromatina para eliminar el daño del ADN? (2) ¿Cómo afecta la maquinaria de transcripción, incluidos los factores de transcripción generales y las enzimas de modificación de histonas, a las diferentes vías de reparación del ADN? (3) ¿Cómo modulan selectivamente las células cancerosas las vías de reparación del ADN para tolerar los agentes quimioterapéuticos? Abordar estas preguntas no solo proporcionará nuevos conocimientos sobre el mecanismo fundamental del sistema de reparación del ADN, sino que arrojará luz sobre nuevas estrategias para sensibilizar a los tumores resistentes a los medicamentos mediante la inhibición de vías específicas de reparación del ADN.

La cromatina modula la reparación del ADN y las mutaciones del cáncer (Mao et al., DNA Repair, 2019)

La cromatina modula la reparación del ADN y las mutaciones del cáncer (Mao et al., DNA Repair, 2019)

Personas y publicaciones de Mao Lab

El Dr. Peng Mao es profesor asistente en el Centro Integral del Cáncer de la Universidad de Nuevo México (UNMCCC). Obtuvo su Ph.D. de la Universidad de Pekín en China. Recibió su formación posdoctoral con el Dr. Mick Smerdon en el taller de reparación de ADN de la Universidad Estatal de Washington (WSU). También trabajó con el Dr. John Wyrick en WSU como profesor asistente e investigador asociado antes de mudarse a la UNM. Su objetivo es desarrollar nuevas herramientas genómicas para comprender cómo las proteínas reparadoras del ADN reconocen y reparan el daño del ADN en el genoma. Al Dr. Mao le gustan los deportes, particularmente el fútbol.

El Dr. Mingrui Duan es profesor asistente de investigación en la UNMCCC. Inicialmente formada como bioquímica en la escuela de posgrado, ha ampliado con éxito sus habilidades a la genómica y la bioinformática. Ella está interesada en comprender el mecanismo por el cual la capacidad mejorada de reparación del ADN en las células cancerosas conduce a la resistencia a los medicamentos en la quimioterapia. Al Dr. Duan le gusta tocar el piano.

  1. Selvam K, Plummer DA, Mao P, Wyrick JJ. (2022). La histona metiltransferasa Set2 regula la reparación por escisión de nucleótidos acoplados a la transcripción en la levadura. PLOS Genética; 18 (3): e1010085.
  2. Duan, M., Sivapragasam, S., Antony, JS, Ulibarri, J., Hinz, JM, Poon, GMK, Wyrick, JJ* y Mao, P*. (2022). El mapeo de alta resolución demuestra la inhibición de la reparación por escisión del ADN por factores de transcripción. Elife 11, e73943.
  3. Jiang LM, Guo F, Tang JJ, Yu H, Ness S, Duan MR, Mao P, Zhao Y, Guo Y. SBSA: un servicio en línea para la anotación de secuencias de unión somática. Investigación de ácidos nucleicos, 2022. 50 (1), e4-e4
  4. Jiang LM, Yu H, Ness S, Mao P, Guo F, Tang JJ, Guo Y. El análisis integral de las comutaciones identifica los mecanismos cooperativos de la tumorigénesis. Cánceres. 2022, 14 (2), 415
  5. Duan MR., Sivapragasam, S., Antony JS., Ulibarri J., Hinz JM., Poon GMK., Wyrick JJ*., Mao P*. Mapeo de alta resolución del daño por alquilación del ADN y reparación por escisión de base en los sitios de unión del factor de transcripción de levadura. bioRxiv. 2021
  6. Sivapragasam, S., Stark B., Albrecht AV., Bohm, KA., Mao P., Emehiser RG., Roberts SA., Hrdlicka PJ., Poon GMK., Wyrick JJ. La unión de CTCF modula la formación de daño UV para promover los puntos calientes de mutación en el melanoma. EMBO J. 2021, e107795
  7. Duan, M., Speer, RM., Ulibarri, J., Liu, KJ., Mao, P. Reparación por escisión de nucleótidos acoplada a la transcripción: nuevos conocimientos revelados por enfoques genómicos. Reparación de ADN. 2021, 103126
  8. Bohm, KA., Hodges, AJ., Czaja,W., Selvam, K., Smerdon, MJ., Mao, P. y Wyrick JJ. Funciones distintas para los remodeladores de cromatina RSC y SWI/SNF en la reparación por escisión genómica. Investigación del genoma. 2021, 31 (6): 1047 1059-.
  9. Sheng, Q., Yu, H., Duan, M., Ness, S., He, J., Kang, H., Jiang, L., Wyrick, JJ, Mao, P*. y Guo, Y* . Una solución optimizada para procesar, dilucidar y controlar la calidad de los datos de secuenciación del dímero de pirimidina de ciclobutano. Protocolos de la naturaleza. 2021, doi: 10.1038/s41596-021-00496-3. (* Autores de correspondencia)
  10. Duan, M., Ulibarri, J., Liu, KJ y Mao, P. (2020). Papel de la reparación por escisión de nucleótidos en la resistencia al cisplatino. Revista Internacional de Ciencias Moleculares. 2020, 21 (23): 9248.
  11. Jiang, L., Duan, M., Guo, F., Tang, J., Oybamiji, O., Yu, H., Ness, S., Zhao, Y.-Y., Mao, P*., y Guo, Y*. SMDB: alteraciones de secuencias somáticas fundamentales que reprograman cascadas regulatorias. 2020, NAR cáncer2(4):zcaa030. (* Autores de correspondencia)
  12. Duan M, Selvam K, Wyrick JJ*, Mao P*. El papel de Rad26 en todo el genoma en la promoción de la reparación por escisión de nucleótidos acoplados a la transcripción en la cromatina de levadura. PNAS. 2020:202003868. (* Autores de correspondencia)
  13. Mao P, Wyrick JJ. Mapeo de todo el genoma del daño del ADN inducido por UV con CPD-Seq. En: Hancock R, ed. Métodos en Biología Molecular. Springer Estados Unidos; 2020: 79-94.
  14. Mao P, Smerdon MJ, Roberts SA, Wyrick JJ, La reparación asimétrica del daño UV en los nucleosomas impone una polaridad de cadena de ADN en las mutaciones somáticas en el cáncer de piel. Investigación del genoma, 2020 Jan;30(1):12-21.
  15. Mao P y Wyrick JJ Organización del daño del ADN, reparación por escisión y mutagénesis en la cromatina: una perspectiva genómica. Reparación de ADN, 2019
  16. Brown AJ‡, Mao P‡, Smerdon MJ, Wyrick JJ, Roberts SA. Las posiciones del nucleosoma establecen una firma de mutación extendida en el melanoma. PLOS Genetics, 2018, 14 (11), e1007823 (‡ Co-primeros autores)
  17. Mao P, Brown AJ, Esaki S, Lockwood S, Poon GMK, Smerdon MJ, Roberts SA, Wyrick JJ. Los factores de transcripción ETS inducen una firma de daño UV única que impulsa la mutagénesis recurrente en el melanoma. Comunicaciones de la naturaleza. 2018; 9(1):2626.
  18. Mao P‡, Brown AJ‡, Malc EP, Mieczkowski PA, Smerdon MJ, Roberts SA, Wyrick JJ. Los mapas de todo el genoma del daño por alquilación, la reparación y la mutagénesis en la levadura revelan mecanismos de heterogeneidad mutacional. Investigación del genoma. 2017; 27(10):1674-1684. PMCID: PMC5630031 (‡: coprimeros autores)
  19. Mao P, Wyrick JJ, Roberts SA, Smerdon MJ. Daño al ADN inducido por UV y mutagénesis en la cromatina. Fotoquímica y fotobiología. 2017; 93(1):216-228. IDPM: PMC5315636
  20. Mao P, Smerdon MJ, Roberts SA, Wyrick JJ. Paisaje cromosómico de formación y reparación de daños UV con resolución de un solo nucleótido. PNAS. 2016; 113(32):9057-62. PMCID: PMC4987812
  21. Mao P‡, Kyriss MN‡, Hodges AJ, Duan M, Morris RT, Lavine MD, Topping TB, Gloss LM, Wyrick JJ. Un dominio básico en la cola N-terminal de la histona H2B es importante para el ensamblaje del nucleosoma por FACT. Investigación de ácidos nucleicos. 2016; 44(19):9142-9152. PMCID: PMC5100577 (‡: coprimeros autores)
  22. Kong M, Liu L, Chen X, Driscoll KI, Mao P, Böhm S, Kad NM, Watkins SC, Bernstein KA, Wyrick JJ, Min JH, Van Houten B. Imágenes de molécula única revelan que Rad4 emplea un reconocimiento dinámico de daños en el ADN Proceso. Célula molecular. 2016; 64(2):376-387. PMCID: PMC5123691
  23. Mao P, Wyrick JJ. Funciones emergentes de las modificaciones de histonas en la reparación por escisión del ADN. Investigación de levadura FEMS. 2016; 16(7). PMCID: PMC5976035
  24. Meas R, Mao P*. La ubiquitilación de histonas y sus funciones en la transcripción y la respuesta al daño del ADN. Reparación del ADN. 2015; 36:36-42. PMCID: PMC4688114 (*: Autor de correspondencia)
  25. Hinz JM, Mao P, McNeill DR, Wilson DM 3er. Actividad nucleasa reducida de variantes de endonucleasa apurínica/apirimidínica (APE1) en nucleosomas: IDENTIFICACIÓN DE RESIDUOS DE ACCESO. El Diario de química biológica. 2015; 290(34):21067-75. IDPM: PMC4543664
  26. Mao P, Meas R, Dorgan KM, Smerdon MJ. El estancamiento de la ARN polimerasa II inducida por daño UV estimula la desubiquitilación de H2B. PNAS. 2014; 111(35):12811-6. IDPM: PMC4156752
  27. Czaja W, Mao P, Smerdon MJ. El complejo de remodelación de cromatina RSC promueve la reparación por escisión de base en la cromatina de Saccharomyces cerevisiae. Reparación del ADN. 2014; 16:35-43. PMCID: PMC4026264