Genómica analítica y traslacional

El Recurso Compartido de Genómica Analítica y Traslacional (ATG) proporciona secuenciación de próxima generación y otros servicios relacionados con la genómica a los miembros del Centro de Cáncer de la UNM y otros usuarios de la UNM e instituciones afiliadas. Los servicios principales implican la secuenciación de próxima generación, utilizando los dos instrumentos Ion Proton S5/XL y el soporte bioinformático experto asociado. Estos incluyen RNA-seq 'a granel' regular, RNA-seq de una sola célula usando el sistema 10x Genomics, secuenciación de ADN dirigida, ChIP-seq y una variedad de otros ensayos, muchos de los cuales se pueden realizar con células o tejidos vivos o congelados. o muestras archivadas (por ejemplo, FFPE). Los instrumentos Ion Proton S5/XL son especialmente adecuados para analizar ARN de mala calidad, por ejemplo, de material FFPE, que son difíciles o imposibles de analizar con otras tecnologías. Los instrumentos generan hasta 100 millones de lecturas por chip de secuenciación, y nos esforzamos por proporcionar una respuesta rápida, si es posible. ATG agregará un nuevo secuenciador Singular Genomics G4 a fines de 2022, que ampliará en gran medida los servicios de secuenciación de próxima generación disponibles internamente.

El recurso compartido cuenta con el apoyo del UNM Cancer Center, incluida la subvención básica del CCSG P30CA118100 y otros fondos, así como con fondos del estado de NM y tarifas de usuario.

El personal experto está disponible para consultas para ayudar a los usuarios a diseñar los mejores experimentos posibles, para maximizar la calidad de los datos que se producen.

Dr. Ness (izquierda) y el personal de genómica

Director de la facultad

Scott A. Ness, Ph.D.
Maestro, Medicina Interna/ Medicina molecular
Despacho: CRF 121; Tel: (505) 272-9883

Director Técnico / Bioinformática

Kathryn (Charlie) Brayer, Doctora en Filosofía

Personal técnico superior

cocinero kel CRF 118 Teléfono: (505) 272-5564
Jennifer Woods CRF 121 Teléfono: (505) 272-3464
Cifrado de Maggie CRF 121 Teléfono: (505) 272-2464